农村自建别墅办理手续齐全是可以申请办理抵押的，有房屋不动产登记证，实际能不能办抵押借款，或是要按照乡村房屋的具体情况来算，例如房屋的使用年限、位置、变现使用价值等，假如房屋变现使用价值低即使办理手续齐全也是没法作为抵押得到个人贷款的。